aINDELs para identificação

Desenvolvimento

O presente exercício compreenderá duas fases. Numa etapa inicial, aos laboratórios inscritos será enviadas uma alíquota do mix de primers necessária para a genotipagem de um 38plex de indels autossómicos em quatro amostras control. O método de genotipagem das amostras é simples e semelhante ao realizado para STRs, compreendendo uma única PCR multiplex seguida de electroforese capilar (Pereira et al., 2009; Pereira & Gusmão, 2012).

Os resultados da etapa inicial reportados correctamente permitirão o acesso à segunda etapa do exercício, que terá por objectivo fazer a caracterização genética da(s) população(ões) de referência de interesse para cada laboratório (minímo de 100 amostras de uma população).

Para realização deste exercício, será fornecida aos laboratórios participantes uma aliquota do mix de primers suficiente para um número de 500 reações. Aos laboratórios interessados em caracterizar um número mais elevado de amostras/populações (para inclusão no presente trabalho) poderá ser enviada uma aliquota extra de primers, mediante solicitação.

Os laboratórios participantes irão receber informação adicional sobre protocolos, métodos de análise e como enviar os resultados.

Antes de 31 de Outubro de 2012, os laboratórios interessados deverão inscrever-se através do pagamento de uma quota de participação no valor de 150 euros. O pagamento deverá ser feito online através da página do GHEP (http://www.gep-isfg.org/ISFG/Portugues/Controle_de_qualidade/formas_pago.php) ou por transferência bancária, indicando claramente o laboratório participante, o nome da pessoa responsável e email de contacto.

Para a publicação dos resultados finais é estabelecido um limite de 1 autor por laboratório, para um minimo de 100 indivíduos amostrados por população. Poderão ser aceites até um máximo de 2 autores por laboratório participante sempre que sejam apresentados dados correspondentes a pelo menos duas populações compreendendo cada uma delas pelo menos 100 amostras.

Requisitos dos participantes

• A pessoa responsável deverá obrigatóriamente ser sócia do GHEP e ter as quotas em dia.
• O pagamento de uma quota de participação no valor de 150 euros no term estabelecido (online ou por transferência bancária).

Prazos

Data limite de inscrição e pagamento: 31 de Outubro de 2012

Data limite de envio de resultados 1ª etapa: 31 de Janeiro de 2013

Data limite de envio de resultados 2ª etapa: 30 de Junho de 2013

Contacto

Rui Pereira (IPATIMUP, Porto, Portugal): rpereira@ipatimup.pt

Leonor Gusmão (IPATIMUP, Porto, Portugal): lgusmao@ipatimup.pt

Referências

R. Pereira, C. Phillips, C. Alves, A. Amorim, A. Carracedo, L. Gusmão (2009) A new multiplex for human identification using insertion/deletion polymorphisms. Electrophoresis 30(21): 3682-3690.

R. Pereira & L. Gusmão (2012) Capillary electrophoresis of 38 noncoding biallelic mini-Indels for degraded samples and as complementary tool in paternity testing. In DNA Electrophoresis Protocols for Forensic Genetics. A. Alonso, Humana Press. 830: 394.